Inferencia de modelos multiepidémicos de la pandemia de COVID-19 en Uruguay: avances, limitaciones y algunas ideas

En noviembre de 2020 presentamos un estudio de la dinámica de la pandemia por COVID-19 y el efecto de algunas medidas no farmacéuticas (NPIs), como el testeo, rastreo y aislamiento y la disminución de la movilidad en Uruguay en el período del trece de marzo al ocho de octubre del año 2020. Con el aval del Comité de Ética en Investigación de la Facultad de Medicina de la Universidad de la República, usamos datos públicos reportados por el SINAE y por Google para inferir modelos epidémicos y el índice de reproducción R diario. R fue estimado usando EpiEstim y mostró dos máximos los días 8 y 102 (R0 = 3.6 ± 2.2 y Rt = 3.1 ± 0.8) y picos los días 132 (Rt = 2.01 ± 0.3), 174 (Rt = 1.54 ± 0.2) y 204 (Rt = 1.45 ± 0.1). Se crearon múltiples modelos tomando propuestas previas e incorporando aspectos originales los que fueron estimados con COPASI. Los principales modelos estimados se caracterizan por tener ocho módulos SEIR encadenados. Se pusieron a prueba modelos que incorporan cambios debidos a la movilidad y/o al trazado de contactos. Usamos el criterio de información de Akaike (AIC) para seleccionar modelos. Los parámetros y especies estimadas brindaron información sobre aspectos de la dinámica de la epidemia. Tomados en conjunto, nuestros resultados nos permiten concluir que el trazado de contactos tuvo una eficacia variable y explica en gran medida el éxito relativo del control epidémico dado el escaso número de casos de ese período. Los resultados muestran que dicho control es delicado y que debe mantenerse el esfuerzo por mejorar  el testeo, rastreo y aislamiento ya que un control pobre estaba ya ocurriendo en el período último de estudio y que mayores esfuerzos de control serían pronto necesarios. Del estudio surgen hipótesis que relacionan el Rt con la movilidad en hogares y el trabajo y la necesidad de colaborar para completar el trabajo con el estudio de la etapa de descontrol progresivo que siguió al 8 de octubre de 2020 y explorar hipótesis algo más complejas.